这个故事发生在上世纪七十年代，主要围绕着曾向阳（唐曾 饰）、小池（战菁一 饰）、于百家和陆小燕等人展开。曾向阳和小池是一对纯洁相爱的恋人。然而，曾向阳误会父亲出轨，导致母亲意外死亡，妹妹走失，父亲伤残。为了寻找妹妹，曾向阳不得不与小池分隔两地。于百家暗恋小池，借助漂亮女孩张闹设计陷害曾向阳。曾向阳被冤入狱，小池在百般误会中嫁给了百家。与此同时，同事陆小燕善良真诚，坚信曾向阳无罪并向他表达了爱意。在艰难岁月中，曾向阳和小燕的感情逐渐加深。贾管教是曾向阳的良师益友，文革结束后成为法院院长，帮助曾向阳洗脱冤屈重返社会。最后，曾向阳准备与小燕结婚，开始新生活。然而，于百家和张闹为了谋得曾家的房产，再次设计圈套。在小燕的帮助下，曾向阳识破了诡计，保住了家族的文化遗产，即曾家大院。
继续展现ICAC如何锲而不舍，打击层出不穷的贪污舞弊罪行，不让繁荣稳定的香港因一小撮人而负上沉重的代价。《廉政行动二○○四》分为五个单元剧，分别是由贩卖外国护照改编的“终极斗智”、由解款车走私案改编的“不一样的赌注”、改编自首宗因身为公职人员行为不当而犯罪的“以权谋私”、廉署同一时间调查两宗涉及税务贪污案件的“猎户天龙”，以及综合所有公营房屋短桩案而成的“短桩”。
小川爱实（木村文乃 饰）是私立女校的国语教师，成长于保守家庭，生活按父母安排步步推进，却逐渐对婚姻与人生感到迷惘。某日，她为拯救被牛郎欺骗的学生，闯入夜店，与牛郎俱乐部“THE JOKER”的男公关熏（拉乌卢 饰）邂逅。熏出身贫困，识字困难，却凭温柔与努力生存至今。两人原本无交集，但在展开秘密“私人辅导”教授文字与社会常识后逐渐拉近距离，在冲突与理解中渐生情愫。然而，社会的偏见、指责与嫉妒接踵而至，由此展开一段跨越世俗的纯爱故事。
1988年，正值改革开放的大时代，张尚儒在台湾的工厂面临人事成本问题难以继续经营，经评估决定带弟弟张弘圣前往中国大陆追求中国梦。张尚儒在大学时期有个铁哥们赵长城，两人因同时爱上刘千荭，兄弟间的感情从此生变。经多年磨练，赵长城在优式集团担任总经理，前往广东设厂后，遂运用自己的资源抢走张尚儒的客户，让张尚儒兄弟两的事业风云变色，面临经营危机。张尚儒在最沮丧的时候，身为儒学大师的村书记张念文，传授张尚儒许多儒家思想，让张尚儒在面临产业危机及赵长城的打压时，均能调整心态产生正能量，度过对手打压、经济危机难关，并让赵长城自食恶果被优式集团解雇。最终，书记张念文才表明身份，原来，张尚儒的父亲张又文在40年前去到台湾前已结婚生子，生下的儿子就是张念文，张家一家人总算团聚。
