八百年前，明帝之子张若尘，被未婚妻池瑶公主杀死，一代天骄就此陨落。 八百年后，张若尘重新活了过来，却发现曾经杀死他的未婚妻， 已经统一昆仑界，开辟第一中央帝国，号称“池瑶女皇”。 张若尘望着池瑶女皇的神像，心中燃烧起熊熊的仇恨烈焰。 “待我重修十三年，敢叫女皇下黄泉”。
本剧讲述了五位量子战队少年卢修、凯拉、杰名、欧泽、齐嘟嘟通过量子隧道穿梭在地球和恐龙世界，接受挑战，守护恐龙和维护两个世界的秩序的故事。他们面临的对手是企图控制两个世界的司徒影和他新的手下威烈团队。幸好，紫露改邪归正，与量子战队并肩作战，全力帮助他们阻止司徒影获取控制两个世界的量子核心。量子战队依然通过神秘的量子力和各种高科技的任务装备，奋力保护着恐龙等野生动物，也奋力保护着两个美丽的世界。
故事描述一个叫屁祖隐的女人带着5岁的少年来到野原广志和美冴的家里，告诉他们自己是广志和美冴的5岁儿子新之助的亲生母亲。二人留宿的当晚，野原家遭到神秘忍者集团的袭击。新之助被绑架了。屁祖隐家是忍者的故乡，世代守护着地球的能量“宁特鲁”的家族。于是，地球的存亡就交给了新之助的忍法。
