第三季改编自原著系列中的第三本《Real Tigers》。
香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。
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开朗乐观的女孩林多美（赵韩樱子 饰）仿佛是被上苍眷顾的幸运儿，她相貌美丽，性格和善，家境优渥，并受过良好教育，如果不是遇到那个曾被她视作真命天子的陈笑飞（蒋毅 饰），她的人生也许会更加令人欣羡。在她和陈走入婚礼殿堂的第四个年头，哥哥林多俊（李泰 饰）也终于决定和女友文馨（海陆 饰）携手终生。文馨拥有不幸的童年和悲伤的恋爱经历，磨难让她的性格朝向错误的方向发展。婚后文馨意外发现，妹夫陈笑飞竟然就是她当年的初恋男友。严重的心理落差加上旧情复燃，让癫狂的种子生根发芽。另一方面，陈在林家的公司中并未得到重用赏识，这也让他心中萌生不满。一场风暴即将向这个看似幸福的富贵之家袭来……
