鲁邦三世发展至今，已有3部TV版，6部剧场版，4部OVA，还有89年起在电视荧幕上不定期播放时长两小时的特别剧场。而这部《鲁邦三世 THE LAST JOB》则是特别剧场的第二十一弹。 在德国的保养所居然发现了日本的国宝级文化财产“地狱如来像”！鲁邦等人想要偷出这尊如来像，却始终被谜之忍者强盗集团组织者莫尔加纳妨碍未能成功，而钱形居然被莫尔加纳所杀……？——鲁邦与莫尔加纳一伙的激烈夺宝战，将在这里白热化。
由于一些小混乱，鲍勃的父亲负责翻修一座古老的城堡。
工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！
十年“欢喜冤家”猪鸟依旧如往常一样“互相拆台”。然而，“不速之客”发射冰球袭击了小鸟岛和猪猪岛，令双方不得不放下芥蒂，小鸟岛昔日英雄胖红联合小鸟伙伴们与曾经的对手“捣蛋猪”雷纳德一行组建了临时联盟，他们将前往全新冰封岛屿上阻止神秘反派的灭世计划。
