相传烈火珍珠旗为大宋镇国神器，宋太祖赵匡胤即借此旗之助，打败群雄，平定天下。惜后蜀女子花蕊夫人（南红饰）将珍珠旗盗走，同葬深谷，不知所踪。数十年后，杨宗保（徐少强饰）自边关回京，赶赴佘太君（李香琴饰）百岁寿诞途中，遇一老汉被人追杀，声称拾获烈火珍珠旗，欲献当今圣上，杨宗保出手相救，并带同回朝引见仁宗（潘志文饰），不料卷入一场精心策划的阴谋中，多亏包青天清明断案，方使杨家百馀口的冤屈平反，并使祸首英王伏诛。
唐代中叶，经历过武后乱政、安史之乱后，终于暂享了一段太平盛世。及至代宗一朝，朝中的两大势力分别是以代宗堂兄晋王为首的一众文臣，及汾阳王郭子仪所领的一众武将。两大阵营常因不同政见而争持不休，晋王与子仪虽然表面关系和洽，但其实平和气氛之下却藏着暗涌……
名叫司马博铭（王志文 饰）的男人是阳光医院响当当的心胸外科大夫，他医术高明，为人正直，是医患可以信赖和托付的对象。某天，阳光医院迎来了几名新成员，他们分别是富家女关姗（刘思言 饰）、在美国深造归来的外科医生韩子航（霍建华 饰）、在学期间成绩突出的巩凡（徐囡楠 饰）、从县级医院送来的代培医生任丘（张浩天 饰），他们全部归于司马医生的麾下学习。这里的病患多种多样，有早产的死刑女囚郝琳、有郁结着诸多秘密乖僻孤独的胸腔积水病人陈佳子……
讲述了宁真童年时期目睹父亲遇害现场，母亲离奇失踪，刑警队长陆征为查清真相惨遭杀害。现场留下的神秘符号“深渊”，将宁真、陆征的女儿陆凡和徒弟曹进几人的命运紧密相连。多年后，“深渊”再现，连环命案，迷雾重重，仿佛陷入无法逃脱的宿命的故事。
