有 230 万人口，其中八成人口为学生的「学园都市」，是比其他地区科技更为先进，并从事「超能力开发」的特殊地区。而整座学园都市中仅有七人的等级 5 超能力者之一御坂美琴，由于她的能力与个性使然，因而被卷入了学园都市中所发生的种种事件……
东方桃子是一名平凡而普通的小女生。一天放学后，她无意中获得一本神奇的花语星卡笔记，通过这本笔记,桃子发现了世间存在一种诞生于自然界的精灵。这些精灵呈兽形或者人形，拥有强大的自然力量，不加以控制会给我们的生活制造出很多麻烦。但是有一种人，能够与精灵沟通，并使用星卡收服精灵，控制和使用它们的力量，我们称之为星卡师。为了解决黑化精灵们造成的麻烦，东方桃子通过努力学会净化精灵的力量，成为了星卡师的一员。并得知自己身负花语公主血脉力量，拥有净化黑化精灵，拯救精灵的重要使命！在收服和了解精灵的过程中，她还收获了两个伙伴
目暮警官、小兰的母亲妃英里、阿笠博士接连遭到不明身份之人的暗算。柯南追踪伤害阿笠博士的凶手，他根据几起案件现场留下的线索发现凶手按照扑克牌的顺序行凶，而且遇害者皆与毛利小五郎有关。目暮提供的线索初步揭开事情的真相，原来毛利当年任职警察的时候曾经逮捕犯下杀人罪的赌徒村上丈，当年也更因这一事件导致毛利离职以及婚姻变故。十年后，服刑期满的村上丈出狱，开始按照扑克牌的顺序向毛利身边之人展开报复。在得知原委后，毛利努力寻找身边与数字有关的人。在这一过程中，各种惊险场面接连出现。而柯南也对案件的真相产生疑惑…
故事围绕着五位少年的校园生活展开，双胞胎兄弟浅羽悠太和佑希，和他们的青梅竹马——冢原要和松冈春，以及转校生橘千鹤。一个个清新淡雅的画面，描绘了五位少年一段段幽默温馨的青春故事。在漫天樱花飞舞中，穗稀高中的学生迎来了开学典礼。四名少年曾经在春天相遇，之后便共同度过了许多个春天，今年的他们成为了穗稀高中的二年级生。新学年的开始，冢原要强迫佑希参加学校的社团，运动神经很发达的佑希却情愿躲在家里看漫画……不久后，个性活泼外向的混血儿橘千鹤转到他们班上，原来他曾经是佑希的童年玩伴。自此，五人开始了属于他们的简简单单但又真真实实的青春生活。
重生成为一株柳树？灵气复苏，万物崛起。重生的柳树也走上了进化之路。能够无限进化的它，是“神力”还是“诅咒”？
本季主要讲述了在始祖灵兽利用无尽能源替布莱克驱逐了体内的黑暗力量后，无尽能源便消失了，正当SPT
在一次星际披萨之旅中，瑞奇和叮当发现邪恶的尼法利厄斯博士发明了一种跨维度传送门装置，可以让他统治整个多元宇宙。勇敢的二人组立即行动，从尼法利厄斯博士手中夺回了“传送门”，然后飞奔而去，将其安全地锁在一家武器博物馆里。然而，在途中，他们遇到了笨手笨脚的夸克船长，他用这件武器意外地释放了一群拥有意识的披萨馅料暴徒，袭击了银河城的居民。瑞奇和叮当必须与这群“美味大军”战斗，并在尼法利厄斯博士用传送门摧毁银河系之前，阻止它落入他的手中。
拜别仙山后，莫衣与百里东君两大绝世高手退隐。萧瑟隐脉已然恢复，重回逍遥天境，雷无桀等人也相继得到仙人馈赠，实力也有不同地提升。众人决心赶赴天启城，江湖一别，朝堂再见。永安王萧瑟、白王萧崇、赤王萧羽三大势力汇聚一堂，夺嫡之争正式上演，谁又将登上那天启乘龙之位.......
