本作将讲述与“结”有关的都市传说。
“月读”是希望与梦想交会的虚拟空间，而舞台幕布将缓缓升起，见证几位少女在此谱写短暂却珍贵的相遇篇章。不久的未来……东京的 17 岁高中生酒寄彩叶过着非常忙碌的生活，努力在打工和学业之间寻找平衡。她的纾压方式是观看很有人气的月见八千代直播，八千代管理名为“月读”的线上虚拟空间。彩叶时常光顾月读，在那里可以体验不同的人生，自由挥洒创意。她就靠着支持八千代度过空闲时间，还会玩战斗游戏赚一点外快。有一天，在回家路上，彩叶发现一根电线杆闪耀着奇异光芒，没想到电线杆里竟然凭空冒出一个可爱的宝宝。彩叶没办法随手抛弃宝宝，只好把她抱回家，眼睁睁看着她迅速长成一个跟自己同龄的少女。“你是辉耀姬吗？”这是你绝对不曾看过的辉耀姬物语。
在一次惊天动地的背叛之后，“无敌少侠”马克为重建自己的生活而战。面对世界末日般的威胁，他发现了新的盟友，并与他最大的恐惧搏斗——他可能会成为他的父亲。
目暮警官、小兰的母亲妃英里、阿笠博士接连遭到不明身份之人的暗算。柯南追踪伤害阿笠博士的凶手，他根据几起案件现场留下的线索发现凶手按照扑克牌的顺序行凶，而且遇害者皆与毛利小五郎有关。目暮提供的线索初步揭开事情的真相，原来毛利当年任职警察的时候曾经逮捕犯下杀人罪的赌徒村上丈，当年也更因这一事件导致毛利离职以及婚姻变故。十年后，服刑期满的村上丈出狱，开始按照扑克牌的顺序向毛利身边之人展开报复。在得知原委后，毛利努力寻找身边与数字有关的人。在这一过程中，各种惊险场面接连出现。而柯南也对案件的真相产生疑惑…
