当熊猫阿宝为成为真正的神龙大侠做准备的时候，他的生父——熊猫李山突然到访。与此同时，拥有神秘力量的反派天煞登场，妄图制服所有高手，统治武林。相传在与世隔绝的熊猫村有着对抗天煞的力量，为了拯救苍生，阿宝与父亲踏上了归途，而阿宝的好伙伴悍娇虎、金猴、灵蛇、螳螂则一同拖延天煞，阿宝不仅肩负着成为真正的熊猫大侠的使命，还要让村民美美等新伙伴练就新功夫，继承乌龟大师的遗志，共同抵挡天煞。
时值龙腾世纪，大地处于一种神秘而阴森的氛围之中。安卓丝蒂教会是当时万众信仰的归属，为了阻止邪恶自私的血魔法师滥用魔法，危害人间，教会严格禁止人民是用魔法，更组建了圣殿骑士负责追查澧清各种可以分子。在这一过程中，腐败罪恶不断滋长，世界愈加黑暗。十年集会将至，信众从四面八方赶到奥莱桑帝国。在此重要时刻，血魔法师蠢蠢欲动，酝酿着更大的阴谋。拜伦所率领的圣殿骑士展开更为缜密的追查，而屠龙一族的女子卡珊德拉也参与其中。阴谋、罪恶混杂其中，拜伦发现，即使来自身边的人也变得不那么可靠，这群忠心耿耿、勇猛无敌的骑士面临前所未有的挑战…
在森林小镇，羚羚羊老大的初代克隆羊已悉数落网！但这位反派首领并未放弃，选择悄然潜入水城，研发出了各具特色...
《超越善恶》原本计划作为该系列的完结篇，但福克斯在最后一刻又购买了几集。因此，最后六集的动画风格有所不同。萨班在菲律宾聘请了一家工作室（简称为菲律宾动画工作室，该工作室也参与了1994年《神奇四侠》系列第二季的制作），因为制作前四季的动画工作室AKOM因其他项目正在筹备中而无法使用。
