第六季故事为第五季结束时，萨德侵占莱克斯的身体，并灌输他跟克拉克一样的超能力，还释放一种病毒到地球。
故事发生在二十世纪三十年代。善良开朗、个性突出的颜小蛮（杨幂 饰）为洗弟妹冤仇来到戴家当丫鬟，同时被两个男人爱上，他们是戴府的大少爷戴问天（李东学 饰）和二少爷戴君涛（孙坚 饰），这让小蛮陷入两难境地。问天沉稳老成，他为小蛮冤情四处奔波，小蛮很是感激。君涛对小蛮用情更深，他无时无刻保护小蛮在感情上不受伤害，即使小蛮故意撒泼，他也一笑了之。因经常顶撞主人，小蛮得罪了戴家的两位女主人方氏（王琳 饰）和袁氏（田丽 饰），后来，方氏罗织罪名将小蛮打入大牢。为救小蛮出狱，君涛对父母谎称小蛮怀了自己的孩子，出狱后小蛮得知君涛的所言毁了自己的名声不依不饶...... ©豆瓣
解放重庆的最后一次战役打响后，西南特区代区长廖一潭部署渣滓洞白公馆特务和刽子手潜逃、潜伏等有关事宜，并全权负责指挥执行一项代号为C30计划的秘密行动。一直隐蔽在敌人内部、代号叫“山鹰”的地下党员将敌人行动目标通知了地下党后失去联系。刚刚建立的重庆市公安部长刘灿作出了三个重大决定：一是吸收地下党联络员黄菊芳加入公安队伍，尽快联系“山鹰”，二是启用伪警察赵金斗加入刑警队；三是组成敌特人员甄别小组。潜逃人员接二连三的袭击解放军，破坏市政重要设施，公安部损失惨重。绰号叫“猫头鹰”的刽子手，多次化装在市区出现破坏，却几次逃脱。周畅经过千辛万苦，终于把“山鹰”的情报送出，公安部周密部署，最后抓获了全部执行C30计划的刽子手。
