联邦调查局：通缉要犯第二季

第六季中，故事始终以两条叙事线索展开。其中一条，他们在岛上。另外一条，他们也坐过那班飞机，但飞机没有出事，因此每个人都在岛外过着完全不同的生活。戴斯蒙发现两个世界之间的连接点，他于是一个个地去找那些曾经同机的人，用各种极端的方式让他们“回忆”起在岛上那段其实他们并没有经历过的日子。很多从不相识的人因此走到了一起，相爱，幸福地生活在一起。而在岛上，他们早就因种种缘由失去了彼此。最后，杰克在父亲的葬礼上见到这些同伴们幸福的笑脸，他也笑了。一直以来在宿命和责任中挣扎的杰克，在“醒”来的那一刻，真正解脱了。

云州市民俗博物馆巡展文物一夜之间被盗，云州市刑警大队队长周正亲自带队成立专案组，全力追踪，周正更是立下军令状，誓要夺回文物，将犯罪分子绳之以法。一番内访外调，众警员查出了盗宝分子彭海、连明和杨合的线索，于是兵分两路，赵利和张扬调查彭海和连明，董欣和冯宽追踪杨合。周正与杜玉亭则坐镇云州。一方面，外调小组历经艰苦，虽然彭海和连明连连死于非命，但却抓获了杨合，另一方面，周正和杜玉亭在云州访查出其他盗宝团伙成员的下落，并利用其中的樊虎将盗窃案主谋陈化成抓捕归案，一番斗智斗勇，陈化成将真正的幕后黑手张明志供认出来。而张明志最终难逃法网，被盗文物也悉数被一一追回。而周正更是通过蛛丝马迹，将博物馆最大的隐患肖雅天的真实面目揭露开来。

在得到线报前往逮捕一起谋杀案的重大嫌疑人的路上，总督察Joanne Davidson注意到异常状况，临时决定带队改道去处理一桩正在发生的持械抢劫案件，从而延误了逮捕嫌疑人的最佳时机。这到底是一个纯粹的巧合还是早有预谋的设计呢？在了解相关情况后，反腐小组AC-12决定介入调查……

拉里为了避免聚会的诡计对他和谢丽尔的关系反倒适得其反，而这激怒了她。为了弥补损失，他同意收留在埃德娜飓风中失去家园的布莱克一家。与此同时谢丽尔计划了她自己的派对，而拉里则选择了一个不幸的蛋糕。