神州浩土，万物有灵，与精灵结成伙伴的天才被称为御灵师。被封印百年的少年石大力意外遇到了来自平行世界的御灵伙伴九尾天狐青青，踏上了成为首席御灵师、寻找自己身世之谜和守护世界的道路。
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该片围绕活泼可爱的螺丝钉展开故事。
佐久间凛子是在芥边侦探社工作的女大学生。她的雇主阿久田边发现了她的才能，当她作为他的助手满足他的要求时，她了解到了阿久田边作为“魔鬼侦探”的秘密一面。
主人公林初本是身世显赫的富家之子，但其父母却突然无故失踪，家族公司也被其父亲的前助理所强占，就连他从小住到大的别墅也被突然出现的所谓债主所霸占，于是他只能暂时去到位于郊区的林家老宅中居住。然而，来到林家老宅的林初，却奇异地发现老宅院落中的一座盆景中突然传来神秘的人声，接着他意外进入到了盆景之中，发现了被封印于盆景内的仙山以及仙人——玄清祖师。玄清祖师发觉林初身上有激发封印的能力，于是决定收其为徒，传授其修炼之法，以帮助自己冲破封印。与此同时，玄清祖师为了报答林初，也答应教授其一些技能，以助其调查其父母失踪事件背后的真相。林初同意了天玄祖师的要求，自此踏上了修炼之路！
在数万年前，梦魔(ナイトメア)想统治整个宇宙，於是派出一大堆魔兽到处侵略。有一群爱好自由的人组成银河战士团与知对抗，不过梦魔的魔兽太多，战士们一个一个倒下了，生还的只有铁面骑士(メタナイト)一个，他相信新的星星战士一定会出现，所以一直活着在宇宙中流浪。他知道DEDEDE大王有魔兽下载系统知后，就成为DEDEDE的部下，因为有魔兽的地方星星战士出现的机率较大。果然新的星星战士－－卡比乘着宇宙船飞来了，但是他比预定的觉醒时间早了两百年，所以什麼都不知道，连说话也不会，不过有很强的战斗潜能。铁面骑士要梦梦(フーム)好好照顾卡比让他成长，以便将来跟梦魔对决。
为了迎接未知的挑战，闪电机甲全新升级加入作战，他们的机车可以变形为机甲状态，动物们可以通过跟小雨点结合进而召唤出带有动物特点的武器，对抗以霹雳为首的恐龙队。护卫队成员们在任务中相互协作，发挥各自特长，不仅帮动物们解决问题，还向动物们学习本领，一起成长！
