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由人类思想和情感产生的“电子脉冲”被用作人工智能辅助装置“Sapotama”的能量来源。在这一惊人发展的阴影下，出现了可怕的怪物。数码兽是通过消耗电子脉冲进化的生物。天马智郎在与突然从他的Sapotama中出现的月光兽相遇后，经历了一段非同寻常的经历。在与泽城京以及赏金猎人小队“黄金黎明”的其他成员一起生活期间，智郎重新下定了决心。人类和数码兽将创造出怎样的未来？
“想洗清嫌疑，方法有很多，语言辩解只是其中的一种，但也是最无力的一种。实力也是一种辩解的方法！”紫川秀，这位在魔族大营内孤身击杀紫川家叛徒的将领，在远东地区神秘圣庙守护长老的支持下，成为了远东地区数十万联合部队的首领。一位新的远东之王——光明王，诞生了！
普利斯凭借拥有超星核的钢齿虎，控制了整个超好玩联盟的日常生活。表面上，外星居民都十分快活与自由，但实际上却是处处受控，甚至连基本生活作息都被彻底打乱。迷糊博士带领着猪猪侠等五名特工和超萌宠，为星盟的居民请命，解决困难。但一次意外，迷糊脑部受了重伤，成了一个神经兮兮的科学怪老伯，并与大伙失散了。在乌吧星城内，一边躲开普利斯的耳目，一边寻找迷糊博士的下落，猪猪侠等人疲于奔命。幸好在外星居民的协助下，猪猪侠和迷糊博士重聚，与此同时，普利斯也率领钢齿虎军团包围了整个迷糊博士的实验室。然而，迷糊博士一改昔日的逃跑战术，最终决定带领猪猪侠等人，堂堂正正地跟普利斯来一场萌宠科技大战。
因为家人工作的原因，原本生活在繁华大都市的鹤木阳渚（高尾奏音 配音）搬到了风景秀美的乡下，并且进入了那里的学校就读。并不适应室外作业的阳渚本想加入学校的手工社团，哪知道在误打误撞之下遇见了名为黑岩悠希（筱原侑 配音）的前辈，在前辈的威逼利诱之下，阳渚最终加入了悠希所在的海堤社。个性大大咧咧，运动神经极为发达的帆高夏海（川井田夏海 配音）、性格沉稳，尤其擅长烹饪的大野真（明坂聪美 配音），再加上一个非常习惯恶搞社员，思维过于活跃和跳跃的社长悠希，阳渚充满了欢笑和汗水的课后部活就此拉开了序幕。
只想归隐田园的我，却意外来到了异世界，在新手村苟成创世级存在，连统治天下的女魔王都被我养的一条狗给打败了。从此，女魔王住在了我的家，异世界的冒险之旅从此开始。
在数万年前，梦魔(ナイトメア)想统治整个宇宙，於是派出一大堆魔兽到处侵略。有一群爱好自由的人组成银河战士团与知对抗，不过梦魔的魔兽太多，战士们一个一个倒下了，生还的只有铁面骑士(メタナイト)一个，他相信新的星星战士一定会出现，所以一直活着在宇宙中流浪。他知道DEDEDE大王有魔兽下载系统知后，就成为DEDEDE的部下，因为有魔兽的地方星星战士出现的机率较大。果然新的星星战士－－卡比乘着宇宙船飞来了，但是他比预定的觉醒时间早了两百年，所以什麼都不知道，连说话也不会，不过有很强的战斗潜能。铁面骑士要梦梦(フーム)好好照顾卡比让他成长，以便将来跟梦魔对决。
200年前，超元世界的人类和来自其他世界的怪兽发生了战争。为了对抗强大的怪兽，人类发明了超元卡装置，将怪兽封印在超元卡中，结束了战争。主人公云天曾是一位热爱超元卡比赛的少年，但是体质特殊的他无法控制好超元卡中的怪兽能量。一天，他意外从爸爸发掘的古遗迹中获得了一个神奇的卡盒。云天决定前往寻找4张传说超元卡，希望用向超元卡许愿的方式找回哥哥。就这样，云天告别了父母，踏上旅程
