家国命运的战争乱流中，不同的人秉持着各自的信念做出迥异的选择，同时承受由此引发的不同的命运。毕业于黄埔军校现为国民党军医的彭天戈（高云翔 饰），坚定着救死扶伤的信念穿梭于枪林弹雨的危险战场。然而他那担任51师参谋长的父亲彭振山（张铁林 饰）战败投降，投敌卖国，却让天戈的命运发生转变。在此之后，他放下救人的手术刀，经过抗日锄奸团火麒麟的训练成为一名令人闻风丧胆的冷血杀手。在这一过程中，天戈与共产党谍报人员宋卓凝（吕夏 饰）、上海滩第一杀手杜善起（吕行 饰）、昔日战友兼恋人柳沉雪（战菁一 饰）产生交集和碰撞。
据福斯电视部门老大加里·纽曼透露，新一季《X档案》可能因主演档期问题，延后至2018年底或2019年播出。但有望由上季的6集扩充至10集。作为经典剧集，《X档案》一直有着一批忠实粉丝。 即使在停播了14年后，于2016年初播出了全新的故事，首集便吸引到1350万观众收看。
这段故事背景设定在二十世纪二十年代的民国初期，充满了天灾人祸和兵乱，民众生活在苦不堪言的环境中。主人公杨逸（朱元冰 饰），一个体内隐藏着龙灵之力的小郎中，由于一场瘟疫事件而被卷入上海各个势力间的复杂争斗之中。在这些争斗中，杨逸结识了上海市市长莫森之女莫小渝（邢菲 饰），并与她展开了一段动人的爱情。然而，背后的黑手是杨逸的师叔多同，他追求“长生”的狂妄幻想驱使他不择手段，散播瘟疫，将人作为药材来炼制禁药，从中获取巨大利润。更甚的是，他不惜暗杀政要，挑拨各方军阀之间的矛盾，意图诱发更大的战乱。多同的最终目标是实现“六祸”，通过血祭众生来达成他个人长生的邪恶目的。他的计划不仅对杨逸和莫小渝构成了重大威胁，也对整个上海以及更广泛的地区稳定和民众生活带来了极大的危害。
