漆黑的夜晚，一名间谍悄然潜入日本警方某机构，盗走了记载着各国谍报机构重要数据的绝密文件的绝密数据。日本警方和FBI探员赤井秀一（池田秀一 配音）旋即与间谍展开追逐。最后，逃亡者的车辆坠落悬崖。第二天，柯南（高山南 配音）和伙伴们来到东都水族馆观光，结果发现一名受伤的美丽女子（天海佑希 配音）。该女子处于失忆状态，身上的手机也破损无法使用。柯南等人答应要帮她恢复记忆，当他们七嘴八舌之际，藏在暗处的黑衣组织成员贝尔摩德（小山茉美 配音）冷冷地注视着这一切。在相处过程中，女子非凡的身手和奇怪的言行举止让灰原哀（林原惠美 配音）对其真实身份产生怀疑。 刚刚还一派祥和的水族馆，沉浸在快乐之中的人们，根本会想到随着那名神秘女子技艺的恢复，自己马上就要被卷入黑暗组织的杀戮和混乱之中……
两万年前的冰河时代，超级不靠谱的希德（约翰·雷吉扎莫 John Leguizamo 配音）带领海狸、食蚁兽、雕齿兽宝宝们展开野营旅行。希德自称森林的主人，大自然的儿子，但看起来它完全没有任何野外生存的经验，先是被马蜂狠命地蜇了一通，还跌落悬崖，接着小家伙们又在它的带领下成功迷路，希德还误尝有毒植物脑袋肿得像个皮球。虽然承受着来自小家伙们的不信任感和鄙视，可是这个超级自信的家伙丝毫不为所动，继续在它犯傻的道路上越走越远。此时此刻，无论是希德还是小宝宝们都没想到，它的无心举止将创造怎样神奇的地貌与历史……
孤僻内向的刺猬少女苏叶，小时候和完美的男神郑树在学校里不打不相识。从此到高中为止苏叶身边唯一的朋友就是郑树。郑树对谁都微笑礼貌行为成熟，唯独在苏叶面前能展现出无理取闹极其幼稚的模样。 从小到大，苏叶和郑树的关系就像他们的名字一样联系紧密，大树和树叶，好像谁也离不开谁。这份从未被定义的关系，到了真正要定义的时候，反而变得复杂。 不知从何时开始，苏叶对这个朝夕相处的青梅竹马产生了不一样的感觉，两人之间原本熟悉的言语和动作竟令她心跳加速。 明明只是一起长大的朋友，却会因为他恰到好处的动作，羡慕亲吻他掌心的发丝；会因为他忧郁的眼神，嫉妒赖在他脸庞的阳光。然而在苏叶心中，郑树只是把她当成朋友。 喜欢一个人往往容易变得自卑，掩盖了很多事实真相。显而易见的是，郑树早在很久之前就喜欢苏叶了，面对她是那副独一无二的幼稚模样就是最好的证明。所幸这是一段没有错过的感情，故事的过程和结局都是甜的。
海婴（伊一 配音）从小就失去了父母，在一个临海的小渔村里过着孤苦伶仃的生活。因为孤身一人，海婴常常受到其他孩子们的欺负，然而，善良的海婴只是选择默默忍耐。海婴觉得，如果自己能够找到母亲，那么她就能够获得朋友们的认可，就这样，小小的女孩踏上了漫漫寻母之旅。哪知道刚刚出发没多久，海婴就被海盗绑架了，众人千里迢迢来到了仙女城，又在意外之中解除了封印使得邪恶的烈焰魔王重现世间。强大的烈焰魔王企图毁灭整个世界，唯有水晶之剑才能够将其降服。通过和妈妈的心灵感情，海婴最终寻得了宝物，她能否凭借自己的力量战胜邪恶，保护世界的和平呢？
现代女医生遭遇车祸，绝世美女也就罢了，竟然穿越古代成为人人喊打的叫花子。刚来就被抓进青楼，却意外得知这青楼的主人居然是当朝太子？不过救醒我的这位师父也太禁欲了。腹黑傲娇冰山公子？温润如玉暖心师父！
叶长生穿越到玄幻世界，开局成为天剑门最年轻的长老，绑定授徒暴击返还系统！ 赐予徒弟什么，系统就能按倍数暴击返还什么！
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柯南在街头目睹一名正打电话的警察在雨中被射杀，忙将凶手追踪，但凶手逃脱。死者闭眼一刻紧抓左胸，似乎有所暗示。事后柯南从目暮警官口中了解到紧抓左胸是暗示那里有警察手册。不久又有警察手拿警察手册被人射杀于地下车库。对于这两起案件，目暮警官等人一反常态不愿向毛利小五郎及柯南透露太多信息。毛利不甘心进一步追问，白鸟警官只答一句“Need not to know”。该话是警察之间所用的密语，意味这两起杀人事件与警察内部人士有关。 柯南、小兰等人参加白鸟妹妹的婚宴，电突然间停掉，那刻小兰正与女警佐藤在洗手间。小兰拿起身边的手电筒欲照明时，一颗子弹射进佐藤身体，小兰吓昏过去。次日小兰醒来，却因怪责自己害佐藤挨枪失去记忆。目暮见事态越来越严重，将秘密说出，原来死去的两名警察正与佐藤一起重查一桩有关医生仁野自杀的案件，该案涉及到警察局长的公子。将局长公子假定为嫌疑人之一时，柯南亦想到佐藤被射杀后宴会上少掉的两个人。
