以主人公安久为轴,描写战斗少女们的群像剧。故事讲述了掌握了高端情报技术“玛娜”的人类,借助它的力量克服了地球上的战争、饥饿、污染等问题,终于迎来了和平的理想乡。然而,作为皇国第一皇女的安久丽莎,却因无法使用这等魔法之力而沦为士兵,并被派遣到偏僻的岛屿上,同其他少女们操纵变形人型兵器“帕拉美露”,共同对抗入侵而至的巨大攻击型生物——龙。于是,少女的不屈物语就此开始了……
酋长马拉库达的儿子本应成为一名真正的战士,但他却完全不懂狩猎,令父亲大失所望。马拉库达独自一人进入森林,找到了神鸟叮叮,叮叮赋予他理解动物和鸟类语言的天赋。马拉库达和叮叮满载而归。小男孩并不知道,根据传统,为了部落的繁荣,必须牺牲这只神鸟。
2013年,瑞士的原子核研究机构“CERN”——在希格斯玻色子这一发现的暗影之下,某个秘密计划启动了。这一计划的名称是“Niantic计划”。其目的是研究干涉人类精神的未知物质。被称为“奇异物质(XM)”的这种物质,自古以来就感应着人们的精神及能力,甚至给人类的历史带来了极大的影响。世界各国的机关暗中进行着这项研究。XM被视为人类的希望或是威胁,大国及巨大企业为此而爆发了争夺战。接受XM的力量,并准备将其利用于人类进化的“启蒙军”。将XM视为威胁,并准备控制它的“反抗军”。世界划分为这两大阵营,至今仍在持续着争斗。在这个世界发生的争斗背后,正是XM的存在。之后,2018年——。以东京和世界为舞台,围绕着XM的新战斗开幕。将动画、在线位置信息游戏以及现实连结起来,从未体验过的全新“增强现实娱乐”开始了。