香港SARS疫潮过后，人们终于从阴霾中走出来。脑外科医生程至美（吴启华饰）突然得知前女友的死讯，情绪崩溃，极度自责抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）伴其左右，鼓励他重新建立信心。急症室医生黎国柱（林保怡饰）结束了与女友的恋情，却卷入与骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）的三角恋中。不幸感染SARS的心脏科医生林敏智（陈豪饰）留下后遗症，为保全名声而隐瞒病情，却令病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急症科医生向众仁（曹永廉饰）正计划共同生活，然而却因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。由香港无线电视制作的现代时装医务纪实电视剧《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三辑，监制戚其义与编剧周旭明的黄金组合更是精心打造此辑“妙手系列”。此辑剧集在风格上延续了前两辑经典之处，一如既往的得到医务人员协助实景拍摄，继续讲述医护人员在工作中的点滴故事。
上世纪二十年代，气质出众的农村少女程婴，报考凌世为在上海新开设的金舞台，路途上偶遇高文中，两个斗气冤家结下重重误会，却逐渐暗生情愫。程婴凭脱俗气质和天生的好嗓音，顺利进入金舞台。高文中多次表达爱慕，却都被程婴拒绝。程婴接近凌世为，令高文中伤心不已。原来凌世为本是程婴的家族仇人，程婴企图接近凌世为，重夺家族权利。程婴偶遇亲生姐姐美柔，本想带姐姐远离是非，谁料姐姐却被凌世为所害。程婴打算亲手报仇，却未遂遇险，幸得家乡故人相救。程婴决心不再鲁莽，而是找出凌世为的犯罪证据。高文中得知真相，抛家舍业帮助程婴，令凌世为最终被绳之以法。高文中用真挚的爱情，为程婴抚平多年的心伤。程婴在真情之下放下了曾经的是非恩怨，与高文中结婚，过起了平淡而幸福的生活。
